آیت‌الله علی خامنه‌ای معترضان به نتایج انتخابات را به «بی‌بصیرتی» متهم کرد و گفت: این عده که سال گذشته ادعای تقلب در انتخابات می‌کردند، به قانون تمکین نکردند.
رهبر ایران، صبح سه‌شنبه، چهارم آبان، در دیدار با گروهی از جوانان و دانشجویان هوادارش در دانشگاه‌های قم، تاکید کرد که این افراد باید برای ادعای خود دلیل می‌آوردند و از راه قانون شکایت خود را پیگیری می‌کردند، تا پس از بازرسی و بازبینی، حقیقت مشخص شود اما آنها راه قانونی را طی نکردند.
آقای خامنه‌ای در سخنرانی دیگری در جمع هوادارنش در قم به اظهار نظر درباره اعتراض‌ها و درگیری‌های پس از انتخابات نهمین دوره ریاست جمهوری پرداخته و گفته بود: فتنه 88، کشور و مردم را بر ضد میکروب‌های سیاسی و اجتماعی واکسینه کرد.
لعنت به آنهائی که فرصت ها را با دروغگوئی و زیاده خواهی سوزاندند\n\nحال باشد که اگر رژیم حماقت نکرد و معترضشان نشد ببینند مردم وقتی دوزاریشان بیفتد که چه کلاهی سرشان رفت چگونه چشمانشان را از کاسه بدر آورند