در سالمرگ آیت‌الله خمینی، که روز شنبه ۱۴ خرداد ماه در کنار مقبره او برگزار شد، آیت‌الله خامنه‌ای در مورد «انحراف» از خط بنیانگذار انقلاب هشدار داد.
او در بخش دیگری از سخنان خود گفت که اگر جریانی بخواهد به نام عقل‌گرایی از ارزشهای انقلاب عدول و نسبت به دشمن «بی‌تقوایی» کند از خط انقلاب منحرف شده است وی همچنین افزود: «اگر به نام عدالت خواهی و انقلابی گری به برادران خود و مردم مؤمن، به کسانی که از لحاظ فکری با ما مخالفند اما می دانیم که به اصل نظام و اسلام اعتقاد دارند اهانت کنیم و آنها را مورد ایذا و اذیت قرار دهیم، از خط امام منحرف شده ایم».
او در ادامه، ضمن مهم خواندن اتفاقات اخیر منطقه آنها را جنبش‌هایی «اسلامی، ضد آمریکایی و ضد صهیونیستی» دانست. آیت‌الله خامنه‌ای در سخنان خود اشاره‌ای به سرکوب خونین معترضان در سوریه نکرد.
