انتقاد شیخ حسن الکافی از مقامات دانشگاه الازهر از برخورد جمهوری اسلامی با اهل تسنن در ایران باعث ناخرسندی آقای احمدی‌نژاد شد. شیخ حسن الکافی از دولت ایران انتقاد کرد و گفت در ایران خلفای سه گانه مورد توهین قرار می‌گیرند و اهالی سنت مورد خشم مقامات دولت شیعی ایران قرار می‌گیرند.

این اظهارات واکنش محمود احمدی‌نژاد را به دنبال داشت. او به شیخ الکافی گفت که ما با هم برادریم و برای صلح به اینجا آمده‌ایم. او همچنین تهدید کرد در صورتی که شیخ الکافی به سخنان منتقدانه خود ادامه بدهد جلسه را ترک خواهد کرد.