ورود انواع آلایندههای صنعتی، سموم كشاورزی و فاضلابهای خانگی علاوه بر مشكلات زیستمحیطی، بر كیفیت و جمعیت ذخایر دریای خزر اثر منفی گذاشته است.
هم چنین تخریب سواحل، نبود سیاست واحد حفظ محیط زیست دركشورهای حاشیه دریا و وجود مهاجم دریایی به نام شانهداران، دریای خزر را با بحران شدید زیست محیطی مواجه كرده است.