آیت الله علی خامنه‌ای، رهبری ایران، تحصیل حدود دو میلیون دانشجو از سه میلیون و نیم دانشجوی کشور در رشته های علوم انسانی را «نگران کننده» خوانده است
آیت الله علی خامنه‌ای، رهبری ایران می‌گوید « تحصیل حدود دو میلیون دانشجو از سه میلیون و نیم دانشجوی کشور در رشته های علوم انسانی، نگران کننده است زیرا «توانایی مراکز علمی و دانشگاه‌ها در زمینه کار بومی و تحقیقات اسلامی در علوم انسانی در حد این تعداد دانشجو نیست.»
نارضایی رهبری از علوم انسانی به این دلیل است که « تعداد اساتید معتقد به جهان بینی اسلامی در رشته‌های علوم انسانی کم است»، مبنای بسیاری از علوم انسانی «فلسفه‌های مادی‌گری و بی‌اعتقادی به تعالیم الهی و اسلامی است» و آموزش این علوم موجب «تردید در مبانی دینی و اعتقادی» می‌شود.
رهبری از مراکز تصمیم گیری از جمله دولت، مجلس و شورای عالی انقلاب فرهنگی خواسته است که به این موضوع رسیدگی کنند.
گفتنی است در جریان چهارمین جلسه دادگاه بازداشت‌شدگان پس از انتخابات که به محاکمه سران اصلاح‌طلبان اختصاص داشت، بخش‌هایی از اعترافنامه منسوب به حجاریان به علوم انسانی و اثرات آن پرداخته بود از جمله این‌که «آشنایی ایرانیان با دستاوردهای جدید در علوم انسانی، موجب رواج دیدگاه‌هایی شده که با شرایط ایران سازگاری ندارد.»
براساس متن تنظیم شده در لایحه دفاعیه حجاریان، «تدریس نظریه‌های علوم انسانی» در دانشگاه‌های ایران «یکی از عوامل ضایعات و صدمات به اموال عمومی در جریان انتخابات اخیر بوده است.»
در دفاعیه منسوب به حجاریان از شورای عالی انقلاب فرهنگی و مسئولان وزارت علوم به دلیل عدم جلوگیری از دسترسی دانشگاهیان به متون علمی خارجی و تدریس آنها، انتقاد شده بود.
مبارزه نرم با بحران پس از انتخابات
آیت‌الله خامنه‌ای با اشاره به بحران پس از انتخابات، آن را «یک آزمون سیاسی تعیین کننده» دانست و گفت که اعتراض‌های پس از انتخابات ناشی از «آزادی های مختلف» در نظام اسلامی است و تاکید کرد «نظام جمهوری اسلامی به دلیل ظرفیت بالای خود توانست بر این مسائل فائق آید.»
وی درعین حال این بحران را «جنگ» و اساتید دانشگاه‌ها را «فرماندهان جبهه جنگ نرم» خواند و به اساتید هشدار داد «قطعا انتظاری که از اساتید دانشگاه ها در این جنگ و مبارزه نرم می رود فراتر از انتظاری است که از دانشجویان وجود دارد.»
وی خطاب به اساتید تاکید کرد که «با شناخت مسائل کلان، شناسایی دشمن و کشف اهداف او، طراحی کلان انجام دهند و براساس این طراحی حرکت کنند.»
آیت‌الله خامنه‌ای همچنین با اشاره به حوادث پس از انتخابات، تاکید کرد که نظام اسلامی در برخورد با تخلف و جنایت، مجامله و گذشت نخواهد داشت.
گفتنی است برخی اظهارنظرها در مورد احتمال تعطیلی دانشگاه‌ها همزمان با آغاز سال تحصیلی به دلیل گسترش اعتراض‌های دانشجویی، مطرح شده است.
