علی مطهری در جلسه علنی روز چهارشنبه در مورد خوانده نشدن گزارش مجلس درباره حوادث کوی دانشگاه در سال ۸۸، تذکر داد. این تذکر درپی خوانده شدن گزارش مجلس درباره وقایع ۲۵ بهمن مطرح شد.
در همین حال برخی از نمایندگان حامی دولت به تذکر علی مطهری، نماینده اصولگرای منتقد دولت در مجلس، واکنش نشان داده و آن را «به منظور تحت‌الشعاع قرار دادن گزارش مجلس درباره وقایع روز ۲۵ بهمن» دانستند.
روز ۲۵ بهمن به دعوت میرحسین موسوی و مهدی کروبی راهپیمایی در حمایت از قیام مردم مصر و تونس برگزار شد که نهایتا به کشته‌شدن دست کم دو نفر و زخمی و دستگیری شماری از معترضان منجر شد.
در رخدادهای شب ۲۴ خرداد سال ۱۳۸۸ در کوی دانشگاه تهران -که حتی به گفته نمایندگان جناح اکثریت مجلس از ابعاد گسترده‌ای برخوردار بود- گروهی از نیروهای نظامی و شبه‌نظامی به دانشجویان حمله کرده و آنها را در نیمه شب به شدت سرکوب می‌کنند. پس از این حمله کمیته حقیقت‌یابی در مجلس برای بررسی آن تشکیل شد، اما هیچ گاه پرونده این حادثه به سرانجامی نرسید.
جمشید انصاری، نماینده فراکسیون اصلاح‌طلبان مجلس چندی پیش گفته بود که اساسا هیچ‌گاه در مجلس کمیته‌ای برای بررسی حمله به کوی دانشگاه تهران تشکیل نشده بود و حتی برخی نمایندگان مجلس به اعضای گروه حقیقت‌یاب اعتراض کردند که با چه اسناد و از کدام جایگاه قانونی موضوع را پیگیری می‌کنند و بنابراین اعضای کمیته هم «با این‌که به نتایجی رسیده بودند، مسئله را مسکوت گذاشته و دیگر پیگیری نکردند».
صادق آملی لاریجانی، رئیس قوه قضائیه، نیز انتقادها را در مورد این پرونده متوجه «نیروهای امنیتی» دانسته و گفته بود که آنها «در پرونده کوی دانشگاه، هیچ کمکی به دستگاه قضائی نکردند» و دستگاه قضائی «براساس اطلاعاتی که از دستگاه‌های دیگر رسید بر روی این پرونده کار می‌کند».
قرائت گزارش مجلس درباره اعتراضات روز ۲۵ بهمن، که مقام‌های حکومتی ایران آن را «فتنه» می‌نامند همزمان با بالا گرفتن حملات جناح اکثریت مجلس علیه میرحسین موسوی و مهدی کروبی و خبرها در مورد «انتقال آنها به زندان حشمتیه تهران» صورت می‌گیرد؛ و یک رو پس از تازه‌ترین اعتراضات در روز دهم اسفند.
