طرح تفکیک جنسیتی از دانشگاه‌ها به دوره پیش دبستانی کشیده شده و براساس بخش‌نامه وزارت آموزش و پرورش در کنار هم نشستن دختر و پسر در کلاس‌های پیش‌دبستانی ممنوع است.

براساس گزارش ایسنا در بخش‌نامه جدید وزارت آموزش و پرورش تاکیده شده است: اختلاط نوآموزان دختر و پسر در کلاس‌های پیش‌دبستانی ممنوع است و فقط در مراکزی که تعداد نوآموزان به حد نصاب نرسد، این امر با کسب مجوز از آموزش و پرورش منطقه بلامانع است.

در مهرماه سال ۱۳۸۲ زمانی که شورای عالی آموزش و پرورش ایجاد مراکز پیش دبستانی را تصویب کرد یکی از اهداف این مصوبه را «کمک به رشد عاطفی کودکان، افزایش حس اعتماد به نفس، درک شرایط محیطی و تقویت درک زیبایی‌ها» اعلام کرده و از موضوع تفکیک دختران و پسران سخن نگفته بود.

طبق تعریف مصوبه آموزش و پرورش «دوره پیش دبستانی به دوره دو ساله‌ای گفته می‌شود که کودکان گروه سنی چهار تا شش سال را تحت پوشش برنامه‌های تربیتی قرار می‌دهد و در نظام آموزشی کشور اجباری نیست.»

تفکیک جنسیتی دختران و پسران از یکدیگر در مراکز پیش دبستانی در آستانه سال تحصیلی جدید و در شرایطی اعلام شده است که طبق برنامه وزارت علوم قرار است از مهرماه سال ۱۳۹۰ نیز طرح تفکیک جنسیتی در برخی از دانشگاه‌های کشور اجرا شود.

براساس گزارش مطبوعات کشور دانشگاه‌های تهران، امیرکبیر، اصفهان، محقق اردبیلی، زابل، هنر شیراز، سهند تبریز و صنعت نفت تهران ازجمله ۲۰ دانشگاهی هستند که قرار است برای نخستین بار در بیش از ۴۰ رشته تحصیلی به‌صورت تک جنسیتی دانشجو بپذیرند.

طرح تغییر ترکیب و تفکیک جنسیتی در مراکز آموزش و پرورش و به‌ویژه دانشگاه‌ها ازجمله موضوعاتی است که در دولت‌های نهم و دهم به ریاست محمود احمدی‌نژاد مطرح شده است.

پس از رویدادهای انتخابات دهمین دوره ریاست جمهوری در سال ۸۸  «اسلامی شدن مراکز آموزشی» بیشتر مورد تاکید قرار گرفت و آیت‌الله خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی، در چند نوبت آموزش علوم انسانی در دانشگاه‌ها را موجب  «تردید در مبانی دینی و اعتقادی» دانسته بود.

تغییر محتوای آموزشی کلاس اول دوره ابتدایی نیز با جهت گیری «آموزش قران» و «آشنایی با اخلاق اسلامی» در همین راستا اعلام شده است. 

اکنون در راستای «اسلامی شدن مراکز آموزشی» کشور،  طرح تفکیک جنسیتی در کنار آموزش دروس قرآنی در مراکز پیش دبستانی نیز اجرا خواهد شد.

دی ماه سال ۸۹ فاطمه قربانی، معاون آموزش ابتدایی وزارت آموزش و پرورش، با اعلام این‌که «محتوای تمام دروس دوره پیش دبستانی قرآنی می‌شود»، به خبرگزاری مهر گفته بود که این وزارت‌خانه درنظر دارد تا «شرعیات و نکات حلال و حرام» را از سنین کودکی به نوآموزان آموزش دهد.

به گفته این مقام مسئول آموزش و پرورش مصوبه‌ای درباره تبیین آموزش قرآن در دوره پیش دبستانی تصویب کرده است.

پس از انقلاب اسلامی سال ۱۳۵۷ طرح تفکیک جنسیتی در دوره‌های دبستان، راهنمایی، دبیرستان و هنرستان اجرا شد.