رهبر جمهوری اسلامی در پیامی، سازمان‌های اطلاعاتی آمریکا و اسرائیل را به «طراحی یا همراهی» ترور مصطفی احمدی روشن متهم کرده و گفته است که جمهوری اسلامی از مجازات مجریان و عاملان پشت صحنه این ترور چشم‌پوشی نخواهد کرد.
آیت‌الله علی خامنه‌ای در پیامی که به مناسبت ترور روز چهارشنبه در تهران منتشر کرده، با «بزدلانه» خواندن این ترور، سازمان‌های سیا و موساد را به دست‌داشتن در این ترور متهم کرده و آن را از جمله «جنایات شبکه تروریزم بین‌المللی دولتی» دانسته است.
آقای خامنه‌ای در این پیام گفته که چنین اقداماتی «نشانه به بن‌بست رسیدن استکبار جهانی به سردستگی آمریکا و صهیونیزم» است.
رهبر ایران پیش‌بینی کرده که عاملان این ترور «به اغراض خود نخواهند رسید. او گفته که «رشد علمی ایران قائم به فرد نیست، بلکه جنبشی است که از این پس هم ادامه خواهد داشت».
مصطفی احمدی روشن، معاون بازرگانی تاسیسات هسته‌ای نطنز، ۳۲ ساله و فارغ‌التحصیل مهندسی شیمی از دانشگاه صنعتی شریف، صبح روز چهارشنبه ۲۱ دی ماه براثر انفجار یک «بمب مغناطیسی» در تهران کشته شد؛ بمبی که اعلام شده توسط دو سرنشین یک موتورسیکلت به خودروی آقای احمدی روشن چسبانده شده است.
آقای احمدی روشن چهارمین متخصص مرتبط با برنامه‌های هسته‌ای ایران است که در دو سال گذشته هدف ترور قرار گرفته است. ترور آقای احمدی روشن یک روز پیش از سالگرد ترور مسعود علی‌محمدی رخ داده است. آقای علی‌محمدی اولین تن از این چهار متخصص مرتبط با برنامه‌های هسته‌ای ایران بود که ترور شد.
جمهوری اسلامی در همه این موارد، آمریکا و اسرائیل را متهم به دست‌داشتن در این ترورها کرده اما آمریکا این اتهام‌ها را رد کرده است.
پیش‌تر حسین شریعتمداری، مدیر روزنامه کیهان و محمدجواد لاریجانی، دبیر ستاد حقوق بشر قوه قضائیه ایران نیز آمریکا، کشورهای غربی و اسرائیل را عامل ترور مصطفی احمدی روشن معرفی کردند.
پس از انتشار گزارش ترور آقای احمدی روشن، برخی از مقام‌های دولتی و سازمان انرژی اتمی ایران اعلام کردند که آمریکا و اسرائیل در کشته شدن او دست داشته‌اند.
حسین شریعتمداری یکی از کسانی بود که در واکنش به این رویداد، سرویس‌های اطلاعاتی آمریکا، اسرائیل و بریتانیا را مسئول ترور مصطفی احمدی روشن دانسته و از «حق قانونی [ایران] برای مقابله به مثل» سخن گفته بود.
آقای شریعتمداری اظهارات مقام‌های اسرائیلی در مورد لزوم آسیب رساندن به تاسیسات اتمی ایران و گزارش‌های مربوط به سخنان یک نظامی پیشین آمریکایی را، دلیل ادعای خود دانسته بود.
مدیر روزنامه کیهان که منصوب رهبر جمهوری اسلامی است، در یادداشتی که روز پنجشنبه ۲۲ دی‌ماه در این روزنامه منتشر شد، نوشت: ترور نظامیان و مقام‌های اسرائیلی به آسانی امکان‌پذیر است و این «جرثومه‌های فساد» به راحتی قابل شناسایی و به آسانی قابل دسترسی هستند.
در همین حال یک روز پس از واقعه ترور مصطفی احمدی روشن، محمدجواد لاریجانی، دبیر ستاد حقوق بشر قوه قضائیه ایران اعلام کرد که در روز وقوع این حادثه نامه‌ای به کمیساریای عالی حقوق بشر نوشته و از این نهاد خواسته است تا کمیته ویژه‌ای برای رسیدگی به این «جنایت» تشکیل دهد.
او که پنجشنبه ۲۲ دی‌ماه در برنامه زنده تلویزیونی «دیروز، امروز، فردا» سخن می‌گفت، تاکید کرد: امروز مرکز تروریسم به ویژه تروریسم دولتی در دنیا آمریکا، کشورهای غربی و رژیم صهیونیستی است.
محمد جواد لاریجانی افزود: ما اسناد و مدارکی داریم که نشان می‌دهد، ریشه و اتاق فکر این ترورهای ضد بشریت در کجا قرار دارد و آماده هستیم که این اسناد و مدارک را ارائه دهیم و «قویا و مصرا» نیز پیگیر کار هستیم.
محمود احمدی‌نژاد، رئیس جمهوری ایران نیز در واکنش به ترور آقای احمدی‌روشن، در پیامی این واقعه را کار عوامل عوامل «استکبار و صهیونیسم جهانی» دانست و آن را محکوم کرد.
بنابر گزارش‌ها پیش از ترور آقای احمدی روشن، بازرسان آژانس بین‌المللی انرژی اتمی با او ملاقات داشته‌اند.
با انتشار خبر ترور آقای احمدی روشن، یوئل گوزانسکی، مسئول پیشین بخش ایران در شورای امنیت ملی اسرائیل، این ترور را بخشی از توطئه بین‌المللی علیه ایران دانست که به گفته او احتمالا توسط عوامل ایرانی استخدام شده در این زمینه انجام شده است.
این کارشناس اسرائیلی همچنین گفته بود که این‌گونه ترورها در اجرای برنامه هسته‌ای ایران تأخیر ایجاد می‌کند و این پیام را به ایران می‌رساند که بهتر است مواضع معتدل‌تری پیش بگیرد.
اما موضع آمریکا در واکنش به حادثه ترور اخیر با استرائیل تفاوت داشت و هیلاری کلینتون، وزیر امور خارجه آمریکا و همچنین تیموتی ویتور، سخنگوی شورای امنیت ملی کاخ سفید، اعلام کردند که آمریکا هرگونه اقدام خشونت‌آمیز ازجمله ترور مصطفی احمدی روشن در ایران را محکوم می‌کند.
محمد خزاعی، سفیر و نماینده دائم ایران در سازمان ملل خواستار پیگیری این سازمان درباره ترور دانشمندان هسته‌ای و محکوم کردن چنین اقداماتی شد.
طی دو سال گذشته چهار «دانشمند هسته‌ای ایران» هدف ترور قرار گرفتند و سه نفر از آن‌ها کشته شدند.
آذر ماه سال گذشته مجید شهریاری و فریدون عباسی دوانی، دو استاد فیزیک دانشگاه شهید بهشتی تهران، در دو بمب‌گذاری جداگانه هدف سوء قصد قرار گرفتند که طی آن آقای شهریاری کشته و آقای عباسی زخمی شد.
دو سال پیش در ۲۲ دی ۸۸ مسعود علی‌محمدی، استاد فیزیک دانشگاه تهران در تهران کشته شد. در ترور این کارشناسان هسته‌ای ایران از بمب مغناطیسی که به خودروهای آن‌ها چسبانده شده، استفاده شده است.
دو روز پس از انتشار خبر ترور مصطفی احمدی روشن، خبرگزاری فارس که به نهادهای نظامی ایران نزدیک است در گزارشی به نقل از «یک منبع امنیتی» از شکل‌گیری عملیات ویژه اطلاعاتی علیه کشورهای غربی در ایران خبر داده است.
این خبرگزاری بدون آوردن نام این مقام امنیتی نوشت که ایران وارد دوران جدیدی از عملیات ویژه اطلاعاتی علیه دشمنان خود خواهد شد؛ «امری که در آن مهارت ویژه و منحصر به‌فردی دارد و البته دامنه پاسخ ایران فرامرزی و منطقه‌ای است».
