آیت‌الله خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی از نمایندگان مجلس خواست طرح سوال از محمود احمدی‌نژاد را متوقف کنند که دقایقی پس از آن، سخنگوی طرحان سوال از انصراف امضاکنندگان نامه سوال از رئیس جمهوری در مجلس خبر داد و علی مطهری آن را حکم حکومتی خواند.
رهبر جمهوری اسلامی روز چهارشنبه، اول آذر در دیدار با جمعی از بسیجیان صراحتا از نمایندگان خواست که طرح سوال از رئیس جمهوری را دیگر ادامه ندهند. به زعم آیت‌الله خامنهای، حضور محمود احمدی‌نژاد در مجلس و اجرایی شدن طرح سوال از رئیس‌جمهوری چیزی است که «دشمن» می‌خواهد.
آیت‌الله خامنهای گفته است: طرح سوال از رییس جمهوری تا اینجا کار مثبتی بود که هم احساس مسئولیت مجلس را نشان می‌داد و هم آمادگی مقامات دولتی برای پاسخگویی.
به دنبال این سخنان، عوض حیدرپور، سخنگوی طراحان سوال از رئیس جمهوری به خبرگزاری مهر گفت که امضا کنندگان این طرح بعد از اطلاع از این درخواست رهبر جمهوری اسلامی، انصراف خود را از ادامه پیگیری سوال از رئیس جمهوری اعلام کردند.
در بیانیه نمایندگان بر فصل الخطاب بودن دستورات رهبر برای نمایندگان تاکید شده و آمده است که آنها به این دستور لبیک گفته و انصراف خود را از پیگیری سوال از محمود احمدی‌نژاد اعلام می‌کنند.
طرح سوال از رئیس‌جمهوری ۱۴ آبان با ۷۷ امضا و محورهای «نوسانات بازار ارز، عملکرد نامناسب بانک مرکزی، گرانی‌های اخیر و مشکلات اقتصادی» به هیئت رئیسه مجلس ارائه شد.
اعلام وصول این طرح با واکنش اعتراضی چند نماینده عضو فراکسیون اصولگرایان همراه بود. آنها معتقد بودند بر اساس اظهارات آیت‌الله خامنهای در دوری از جنجال تا انتخابات سال ۹۲، نباید این طرح اجرا شود. محمود احمدی‌نژاد در روزهای گذشته از اعلام آمادگی برای حضور در مجل سو پاسخ به سوالات در «چارچوب منافع نظام» خبر داده بود.
در روزهای گذشته هم این اختلاف نظرها بین فراکسیون رهروان ولایت که منتقد دولت هستند با فراکسیون اصولگرایان که نزدیک به دولت ارزیابی می‌شوند ادامه داشت. در این بین غلامعلی حداد عادل، رئیس فراکسیون اصولگرایان مجلس که موضع‌گیری‌هایش به نوعی مورد تائید رهبر ارزیابی می‌شود با انتقاد از طرح سوال از رئیس جمهوری در مقطع کنونی از تلاش برای منتفی شدن این موضوع در مجلس سخن گفته بود.
مطهری: تابع حکم حکومتی هستیم
در واکنش به دستور رهبر جمهوری اسلامی، علی مطهری از بانیان طرح سوال از محمود احمدی‌نژاد گفت که هنوز معتقد است طرح سوال از رئیس جمهوری مفید است اما به دلیل حکم حکومتی آیت‌الله خامنهای سوال منتفی می‌شود.
آقای مطهری که سال گذشته هم برای اولین بار طرح سوال از رئیس جمهوری را در جمهوری اسلامی مطرح و عملی کرد، امروز به مهر گفت با توجه به حکم رهبر سوال از رئیس جمهور خود به خود منتفی می‌شود.
علی مطهری در این مدت در پاسخ به استدلال مخالفان سوال از رئیس‌جمهوری که به گفته‌‌های آیت‌الله خامنهای اشاره می‌‌کردند، بارها گفته بود که از سخنان رهبر ایران، استقلال مجلس را استنباط می‌کند و این موضوعی مربوط به مجلس است
او در برنامه دو هفته پیش «دیروز، امروز، فردا» که از شبکه سوم پخش می‌شود هم از طرح سوال از رئیس‌جمهوری دفاع کرده بود. در نظرسنجی این برنامه، بیش از ۷۹ درصد رای‌دهندگان، موافق طرح سوال از رئیس‌جمهوری بودند.
در اولین تجربه سوال از رئیس جمهوری در جمهوری اسلامی اسفند سال گذشته محمود احمدی‌نژاد در مجلس حضور یافت که لحن پاسخ به سوالات از طرف او با اعتراض شدید نمایندگان مواجه شد و آن را توهین به جایگاه نمایندگان و مجلس ارزیابی کردند.
