آیت‌الله خامنه‌ای گفته است از مسئولان دانشگاه‌ها خواست «با مدیریت و قدرت خود از سواستفاده جریان‌های سیاسی از دانشگاه‌ها جلوگیری کنند» و در عین حال گفته است اگر دانشگاه به‌كلی از سیاست دور باشد خالی از شور و نشاط می‌شود و به محلی برای رشد میكروب‌های خطرناك فكری و رفتاری تبدیل خواهد شد
آیت‌الله علی خامنه‌ای، رهبر ایران، معتقد است: اگر دانشگاه به‌كلی از سیاست دور باشد خالی از شور و نشاط می‌شود و به محلی برای رشد میكروب‌های خطرناك فكری و رفتاری تبدیل خواهد شد.
آیت‌الله خامنه‌ای روز سه‌شنبه 13 بهمن در دیداری که به اعلام وبسایت اطلاع‌رسانی او با گروهی از استادان و مسئولان دانشگاه تهران داشته، گفته است: معنای سیاسی شدن دانشگاه ها این نیست كه مراكز علمی به محلی برای استفاده جریان‌ها و عناصر سیاسی تبدیل شوند.
رهبر ایران از مسئولان دانشگاه‌ها خواست «با مدیریت و قدرت خود از سواستفاده جریان‌های سیاسی از دانشگاه‌ها جلوگیری کنند».
آیت‌الله خامنه‌ای در شرایطی مسئولان دانشگاه‌ها را برای اعمال مدیریت و قدرت خطاب قرار داده است که یک ماه پیش 88 نفر از اساتید دانشکده فنی دانشگاه تهران با نوشتن نامه‌ای سرگشاده به وی خواستار جلوگیری از «برخوردهای خشن و فراقانونی» با دانشگاهیان و دانشجویان کشور شدند.
پس از اعلام نتیجه انتخابات اخیر کشور، نیروهای لباس شخصی چندین بار به دانشگاه‌ها و خوابگاه‌های دانشجویی در تهران، اصفهان و شیراز حمله کردند.
انتقاد از خشونت‌های اعمال شده در دانشگاه‌ها به جایی رسید که مجلس هیاتی را مسئول بررسی این موضوع کرد و آیت‌الله خامنه‌ای هم در یکی از سخنرانی‌های خود از عوامل این حملات انتقاد کرد.
نگاه خوش‌بینی
آیت‌الله خامنه‌ای بار دیگر با اشاره به بحران پس از انتخابات که با اعتراض‌های گسترده نسبت به اعلام پیروزی محمود احمدی‌نژاد همراه بود، گفته است: نگاه و بنای بنده بر خوش‌بینی است و به همین علت معتقدم برخی مسائل و حوادث تلخ ماه‌های اخیر، بر اثر غفلت‌های بزرگ برخی اشخاص به‌وجود آمد.
وی هشدر داده است «باید توجه داشت كه در عرصه سیاست، غفلت و اقدامات غیرمتعمدانه نیز گاه همان نتایج خیانت را به همراه می‌آورد.»
آیت‌الله خامنه‌ای که به احمدی‌نژاد به عنوان پیروز انتخابات ریاست جمهوری اخیر تبریک گفته بود، در نخستین نمازجمعه تهران پس از انتخابات در روز 29 خرداد، شیوه‌های معترضان به نتیجه انتخابات در تظاهرات خیابانی را نادرست خواند.
در روز 30 خرداد یعنی یک روز پس از سخنرانی آیت‌الله خامنه‌ای، نیروهای امنیتی از تجمع معترضان به نتیجه انتخابات در میدان انقلاب تهران جلوگیری کردند که درنتیجه درگیری‌ها، شماری از معترضان کشته شدند.
برنامه‌ریزی 50 ساله
آیت‌الله خامنه‌ای نقش دانشگاه تهران را در شتاب بخشیدن به روند پیشرفت علمی كشور، مهم و الگوساز خوانده و گفته است که می‌توان با برنامه‌ریزی 50 ساله، کشور را به رده‌های اول علمی جهان رساند.
وی اعلام کرده است که پیشرفت‌های مهم سه دهه اخیر، راضی‌كننده نیست و ایران با قله‌های علمی جهان، فاصله زیادی دارد که «طی كردن آن، تلاش مضاعف، پیگیر و خستگی‌ناپذیر نخبگان، دانشمندان، فرهیختگان و دانشجویان را می‌طلبد.»
رهبر کشور پیشرفت‌های مهم علمی سه دهه اخیر در ایران را نتیجه «آزادی و آزادفكری» دانسته است.
آیت‌الله خامنه‌ای فرهنگ را یکی از اولویت‌های دانشگاه‌ها دانسته و تاکید کرده است که پرورش فرهنگی دانشجویان مسئله‌ای بسیار ظریف است که «نیازمند برنامه‌ریزی صحیح در تدوین كتاب‌ها، انتخاب استادان و برنامه‌های گوناگون دانشجویی» است.
وی مدیران و مسئولان دانشگاهی را به عنوان متولیان «تعمیق معرفت دینی در روح دانشجویان جوان» کشور معرفی کرده است.
پیش‌تر رهبر در نهم شهریور امسال در جمعه استادان دانشگاه‌های کشور با ابراز نگرانی از آموزش علوم انسانی در دانشگاه‌های کشور که به گفته او مبتنی بر «فلسفه‌های مادی‌گری و بی‌اعتقادی به تعالیم دینی است» ، استادان دانشگاه‌ها را «فرماندهان جنگ نرم» نامیده بود.
