نماینده رهبر ایران در سپاه به طور تلویحی از حمایت این نهاد از محمود احمدینژاد ابراز پشیمانی کرده و گفته که آیت‌الله خامنه‌ای نسبت به شعارهای رئیس دولت نظر مثبت داشت وگرنه این‌طور نبود که از او در انتخابات حمایت کند.
علی سعیدی در گفت‌وگویی با روزنامه اعتماد که روز دوشنبه یکم آبان منتشر شده، با اشاره به اینکه حمایت‌های قبلی خود را از او انکار نمی‌کند، گفته «ما که علم غیب نداشتیم تا بدانیم در ذهن آقای احمدینژاد چه می‌گذرد و در آینده ایشان می‌خواهد چه کار کند.»
محمود احمدینژاد در دوره انتخابات ریاست‌جمهوری نهم و دهم در حالی به ریاست دولت رسید که بار‌ها نامزدهای معترض به نتیجه انتخابات، سازمان‌ها، احزاب و فعالان سیاسی داخلی و خارجی ایران که مخالف دولت بودند، سپاه را به حمایت از او متهم کردند.
در انتخابات مناقشه‌برانگیز سال ۸۸، علی سعیدی به صورت آشکار از نقش سپاه پاسداران در سرکوب‌های بعد از انتخابات دفاع کرده بود و اکنون نیز گفته که شورای نگهبان در تایید صلاحیت میرحسین موسوی و مهدی کروبی «کم‌دقتی» کرده بود که به اعتراض‌های خیابانی منجر شد.
این نماینده رهبر ایران در سپاه در مصاحبه خود گفته است که «ما تا مادامی که حرکت آقای احمدینژاد در قالب استاندارد‌ها و شرایطی که مقبول نظام بود، تائیدش می‌کردیم.»
او در پاسخ به این پرسش که «حالا که کار آقای احمدینژاد به اینجا رسیده به نظر شما این وضعیت حاصل بی‌دقتی کدام بخش‌های نظام است»، گفته است که شورای نگهبان علم غیب ندارد و عوامل روحی، درونی و بیرونی دلیل تغییر احمدینژاد است.
آقای سعیدی افزوده است که این مشکل آقای احمدینژاد را شخصا به او گفته و تاکید کرده «شما می‌توانستید قهرمان شوید اما متاسفانه نشد و از این بد‌تر نمی‌شود که شما همه کسانی را که هوادارتان بودند به مخالفان خود تبدیل کردید.»
او از جمله درباره تغییرات رئیس‌جمهوری ایران گفته «نمی‌دانم این کوفتی، ارتباط با آمریکا، چه هست که آقایان می‌خواهند مدالش را بر گردن خودشان بیندازند. من واقعا نمی‌دانم الان در ذهن احمدینژاد چه می‌گذرد که بحث ارتباط با آمریکا را مطرح می‌کند.»
مذاکره با آمریکا موضوعی است که از سال‌ها پیش در محافل سیاسی ایران مطرح بوده اما در حالی که پیش از دوره محمود احمدینژاد، تابو بود پس از ریاست‌جمهوری او، بار‌ها آشکارا توسط خودش مطرح شده است.
اظهارت آقای احمدینژاد در حالی بار‌ها توسط چهره‌های سیاسی و نظامی داخل ایران رد شده که پیش‌تر آیت‌الله خامنه‌ای در حمایت از او سه سال پیش گفته بود «نظرش در سیاست خارجی به نظر آقای احمدینژاد نزدیک است.»
علی سعیدی در بخش دیگری از سخنان خود گفته حتی گاهی ائمه معصوم هم به افراد اعتماد می‌کردند و زمانی که منحرف می‌شدند هم نظر ائمه تغییر می‌کرد اما مشکل اینجا است که دست شورای نگهبان بسته است.
به گفته او برای اداره نظام، «سقف کوتاهی در نظر گرفته شده در حالی که این سقف خیلی بلند است و آدم‌هایی که می‌خواهند بیایند اینجا باید از استانداردهای دیگری برخوردار باشند و ما که علم غیب نداشتیم تا بدانیم در ذهن آقای احمدینژاد چه می‌گذرد.»
همچنین این نماینده آیت‌الله خامنه‌ای تاکید کرده که از بین رفتن مقبولیت، مشروعیت نظام را از بین نمی‌برد و باید برای تمام نهادهای انتخابی از جمله مجلس، خبرگان، شورا‌ها و ریاست‌جمهوری فکری اساسی شود.
رابطه میان دولت و رهبر جمهوری اسلامی ایران نیز در سال گذشته به دنبال برکناری وزیر اطلاعات توسط محمود احمدینژاد و ابقای آن توسط آیت‌الله خامنه‌ای تیره شد و به خانه‌نشینی یازده روزه‌اش و انتقاد شدید هواداران حکومت از او انجامید.
در پی این رویداد، مجتبی ذوالنور، جانشین علی سعیدی گفته بود «نمی‌دانستیم احمدینژاد چنین رفتارهایی خواهد کرد اما با تمام این احوال در مقایسه با میرحسین موسوی و مهدی کروبی بازهم احمدینژاد را انتخاب خواهیم کرد».
آقای سعیدی پیش‌تر نیز گفته بود دولت گرفتار «بلای بزرگ» شده و رهبر ایران باید با انحراف در دولت برخورد کند چرا که موضع‌گیری رئیس‌جمهوری در امور داخلی و خارجی «آرمان‌های انقلاب و رهبری» در تضاد است.
